一九四八年至一九四九年初，人民解放军从战略防御转入战略进攻，辽沈、淮海、平津三大战役之后，相继解放西安、兰州，直逼河西。国民党南京政府电令新疆驻军入关参战。是去是留，是起义还是抵抗，对身为西北长官公署副署长兼新疆警备司令的陶峙岳将军和新疆十万官兵是必须作出的重大历史抉择。
新疆地处祖国边陲，外有强敌，内有忧患，多民族、多宗教，在国内局势急剧变化的形势下，民族、军队、政界各派政治力量间的关系敏感而又复杂，稍有不慎，轻则战乱不止，重则领土不保。军队的去留，是新疆稳定与否的决定性因素。陶峙岳将军一贯真诚爱国，拥护孙中山先生的三民主义，赞同共产党实行国内和平的主张，在这重要的历史关头，凭借自己的良知，对国家民族的责任感和历史的使命感，在党的统一战线和张治中将军感召下，置个人的安危毁誉于不顾，团结爱国官兵和政府官员，排除各种干扰，毅然做出和平起义的正确抉择，于九月二十五日通电全国，使新疆避免了战乱，为自己和十万官兵，也为新疆各族人民选择了光明的前途。
起义的道路并非坦途。时值陶将军只身入新六个月，对官兵很不了解。驻疆部队原分属胡宗南、马步芳旧部，自成体系。师、旅级将官掌握实权，在去与留、起义和抵抗的问题上分为主战派和主和派。为实现和平起义，他积极派人和张治中将军、共产党人接触，并亲赴南疆联络新疆警备副司令赵锡光密定起义事宜，为和平起义奠定了基础。当时，北疆握有重兵的主战派为达目的密谋兵变，拘捕主和派将领和政府官员，挟持陶将军破坏和平起义，制造动乱分裂。一场战乱迫在眉睫。陶峙岳将军当机立断，不带一兵一卒，只身深入虎穴，理智地分析了国家和新疆所面临的形势，动乱将给国家、民族、个人带来的后果，剖陈利害与是非，动之以情，晓以大义，消除其暴动的念头，凭借大智大勇，消弥了战祸。挽救了军队和新疆人民。当主战派发生反复时，他义正辞严地进行斗争，并设法解除其兵权，将其礼送出境。在中共联络员邓力群来疆带来毛主席发出的张治中给陶峙岳将军、包尔汉的电报，宣传党的政策时，陶将军更是欣喜非常，很快将复电交邓力群同志并表示，为新疆和平大计，为十几个民族的人民，为了十万官兵，我陶某已是早就下定决心的。现在更是义无反顾，个人的安危毁誉，我早就置之度外了。他不仅派自己的警卫部队保护邓力群同志，还安排有关将校做军队和社会各界的工作，为和平解放新疆而奔走努力。
起义后的一段时间内，解放军尚未入疆，一些官兵受敌特蒙蔽和煽动，对起义不满，时常发生骚乱。陶将军亲自出面宣传安慰。一次他去对起义官兵讲话，一些人在会场鸣枪准备暴乱，陶将军不顾个人安危，跨上讲台拍着胸部说，谁要开枪就朝我这里打吧！他以大无畏的精神，镇住了哗变。随后组织宣慰组、军法组等宣传安慰军队，惩办骚乱动乱，救济灾民，稳定了军心、民心，为解放军顺利入疆奠定了基础。解放军进疆后，陶将军率领起义官兵协助解放军进军全疆，把五星红旗插遍天山南北，昆仑之巅，揭开了建设新疆、保卫新疆的新篇章。
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